機動戰士高達 - 鐵血之孤兒故事描述，在被稱為厄祭戰的大戰結束後 300 年，地球圈捨棄了過去的統治方式，以新的支配體系構築了全新的世界。但就在遙遠的火星圈上，新的戰爭火種卻悄悄的誕生…
主角三日月•歐卡斯所屬的民間保全公司Chryse Guard Security，接受了想要使火星都市Chryse從地球勢力統治下獨立的少女クーデリア・藍那・バーンスタイン的護衛任務。但 CGS 卻被負責摘除任何叛亂因子的武裝組織Gjallarhorn襲擊，而利用了三日月等小孩作為誘餌展開撤退。
少年們的領袖奧爾嘉趁機向過去欺凌他們的大人揭起反叛的旗幟，向三日月請求擊退加拉爾組織。就在此時，三日月啟動了在過去厄祭戰中使用，目前作為 CGS 動力爐的機動戰士高達Barbatos、所羅門七十二柱魔神之一為故事揭開序幕…
